ProImmune 针对 II 类等位基因的 MHC 肽结合测定是一种强大的无细胞体外测定,可以快速预测任何蛋白质序列中的 CD4+ T 细胞表位。该测定法鉴定了蛋白质序列中最可能的免疫原性肽,因此可以在新型免疫疗法的开发中发挥关键作用。当应用于治疗性蛋白质时,这些信息可用于帮助开发 T 细胞表位消耗的蛋白质工程策略,以避免不良反应和中和抗体。
II 类 HLA 肽结合测定HLA 肽结合测定可与结合速率和解离速率测定或稳定性测定相结合,以提供有关结合特性的深入信息该技术广泛应用于癌症、传染病、自身免疫和移植等许多疾病领域,非常适合时间压力严格的治疗计划.
与发现 T 细胞抗原的传统方法(例如功能性细胞测定)不同,该测定不会消耗宝贵的患者样本,并且具有一步即可确定每种抗原的 HLA 限制的优点。因此,该技术可显着节省时间,并有助于降低表位发现项目的总体成本和风险。
结合测定可用于 26 HLA-DR、11 -DQ 等位基因和 19 -DP 等位基因(请参阅下表列出了完整列表),以及小鼠 II 类等位基因 H-2 IAb 和 IAd。
尽管有多种结合预测算法可用于肽与 II 类 HLA 等位基因的结合,但硅方法并不总是与物理结合数据很好地相关。 ProImmune REVEAL® II类HLA结合检测通过确定地确认肽序列是否与HLA等位基因结合来克服这些局限性,从而消除了算法方法产生的高比例假阳性和假阴性结果的严重问题。
ProImmune REVEAL® II 类快速表位发现系统模块详细信息模块 1:定制肽合成HLA-肽结合测定需要一组合成肽,这些合成肽是 ProImmune 服务的一部分提供的。肽序列是由已知蛋白质生成的重叠肽库。 ProImmune 的技术顾问可以协助您设计适合您感兴趣的蛋白质的肽库。
模块 2:ProImmune REVEAL® II 类 HLA-肽结合测定高通量 HLA-肽结合测定是定制的决定的服务与阳性对照肽相比,每个候选肽与一个或多个II类HLA等位基因结合的能力。该测定是对每种肽稳定 HLA-肽复合物的能力的测量。检测基于该 HLA-肽复合物是否存在天然构象。
目前有 55 个 DR、DQ 和 DP 等位基因可用于 HLA-肽结合测定。
ProImmune REVEAL®可用MHC等位基因II类:HLA DRDRA1*01:01/DRB1*01:01
DRA1*01:01/DRB1*15:01
< p>DRA1*01:01/DRB1*03:01DRA1*01:01/DRB1*04:01
DRA1*01:01/DRB1*11:01< /p>
DRA1*01:01/DRB1*13:01
DRA1*01:01/DRB1*07:01
DRA1*01:01/DRB1* 01:02
DRA1*01:01/DRB1*04:02
DRA1*01:01/DRB1*04:04
DRA1*01: 01/DRB1*04:05
DRA1*01:01/DRB1*04:07
DRA1*01:01/DRB1*04:08
DRA1*01:01/DRB1*08:04
DRA1*01:01/DRB1*09:01
DRA1*01:01/DRB1*10:01
>DRA1*01:01/DRB1*11:02
DRA1*01:01/DRB1*11:03
DRA1*01:01/DRB1*11:04
DRA1*01:01/DRB1*15:02
DRA1*01:01/DRB1*15:03
DRA1*01 :01/DRB1*16:01
DRA1*01:01/DRB1*16:02
DRA1*01:01/DRB3*02:02
DRA1*01:01/DRB3*03:01
DRA1*01:01/DRB5*01:01II 类:HLA DQ
DQA1*01:01/DQB1*05:01
DQA1*05: 01/DQB1*03:01
DQA1*01:02/DQB1*05:02
DQA1*01:02/DQB1*06:02
DQA1*03:01/DQB1*03:02
DQA1*01:02/DQB1*06:04
DQA1*05:01/DQB1*02:01
>DQA1*02:01/DQB1*02:02
DQA1*03:01/DQB1* 03:01
II 类:HLA DP
DPA1*01:03/DPB1*01:01
DPA1*01:03/DPB1*02:01
DPA1*01:03/DPB1*02:01
p>DPA1*01:03/DPB1*03:01
DPA1*01:03/DPB1*04:01
DPA1*01:03/DPB1*04:02
DPA1*01:03/DPB1*05:01
DPA1*02:01/DPB1*01:01
DPA1*02:01/DPB1*02:01
DPA1*02:01/DPB1*03:01
DPA1*02:01/DPB1*04 :01
DPA1*02:01/DPB1*04:02
DPA1*02 :01/DPB1*05:01
DPA1*02:01/DPB1*06:01
DPA1*02:01/DPB1*09:01
DPA1*02:01/DPB1*11:01
DPA1*02:01/DPB1*13:01
DPA1*02:01/DPB1*14:01
DPA1*02:01/DPB1*14:01
p>DPA1*02:01/DPB1*15:01
DPA1*02:01/DPB1 *17:01
DPA1*02:02/DPB1*05:01
表 1. 显示当前可用于的 DR、DQ 和 DP 等位基因II 类 HLA 肽结合测定。
每个肽都会相对于阳性对照肽(已知的 T 细胞表位)进行评分。此外还显示了中间对照肽的结果以供比较。中间对照是已知的 T 细胞表位,或者在某些 II 类等位基因的情况下,是等位基因 α 和 β 对中 β 链的已知表位。分数以测试肽与阳性对照肽产生的信号的百分比定量报告。客户可以选择任何或所有通过 HLA 肽结合测定的肽进行进一步的速率或稳定性测定。
结合测定也适用于双鼠等位基因 H-2 IAb 和 H-2 IAd。
ProImmune REVEAL® II 类完整速率测定开启速率和解离速率测定将提供有关结合亲的动力学信息单个肽的特性。这些测定对于中等亲和力肽尤其重要,与高亲和力肽相比,中等亲和力肽可能表现出较慢的与特定 HLA 等位基因的结合。如果还看到缓慢的解离速率,则表明一旦肽结合,它可以呈递相当长的一段时间,因此值得作为潜在表位进行进一步研究。结合速率快的肽并不能保证是更好的表位。对它们的动力学进行更详细的研究可能会发现它们也具有快速的解离速率,这意味着它们可能不是好的候选表位。如果用于最终表位验证的细胞样品的供应率测定数据有限,也可用于优先考虑最有希望的候选肽的下游工作。完整速率测定可用于以下 II 类等位基因:
DR1 (DRB1*01:01)、DR2 (DRB1*15:01)、DR3 (DRB1*03:01)、DR4 (DRB1) *04:01) DRB1*04:05、DR5 (DRB1*11:01)、DR7 (DRB1*07:01)、DR9 (DRB1*0901))。
查看《Blood》杂志上发表的一项研究中如何使用完整速率测定
ProImmune REVEAL® II 类快速检查稳定性测定快速检查稳定性测定可用于任何DR、DQ 和 DP II 类等位基因,并且必须与模块 2:HLA-肽结合测定同时订购。稳定性测定在 37°C 下测量零时间和 24 小时时与等位基因结合的肽量,并给出 HLA-肽复合物的稳定性指示。每个肽都有一个\"稳定性指数”,可以比较不同肽表位的相对稳定性。
HLA-肽结合测定比肽的稳定性更能反映肽的结合速率特性。组装的综合体。然而,当稳定性测定和结合测定的结果结合起来时,后续数据提供了更完整的信息,表明肽是否可以呈递足够长的时间以使其成为良好的 T 细胞表位。蒂s 指数提供了一种比较所测量等位基因的不同肽的结果的方法。结果可以作为一种经济有效的方法来优先考虑哪些肽值得在功能性细胞测定中进一步研究,并使用户能够优化细胞样本的使用和测试所需的时间。
表位验证通过 HLA 肽结合测定鉴定结合肽后,可以使用细胞测定(例如 ELISpot、细胞内细胞因子染色和 T 细胞增殖测定)确认那些属于功能性 T 细胞表位的肽。 ProImmune 提供所有这些检测作为一系列细胞分析服务的一部分。虽然对患者细胞的最终验证始终需要相关细胞样本的资源和实验室时间,但 HLA 肽结合和速率测定的数据有助于充分利用这些资源。
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